Por la Constitución Apostólica «In Orbis Catholici» del 11 de enero de 1946, el Papa Pío XII creó la Prefectura Apostólica de San Francisco Javier del Marañón, confiándola a la Compañía de Jesús. El 8 de junio de 1971, SS. Paulo VI elevó la Prefectura Apostólica de San Francisco Javier, a Vicariato Apostólico. Desde el 22 de noviembre de 1980, el nombre oficial es “Vicariato Apostólico de Jaén en Perú o San Francisco Javier”. Comprende la provincia de San Ignacio, la parte oriental de Chachapoyas (distritos de Imaza y Aramango de la Provincia de Bagua-Amazonas) y del Vicariato Apostólico de Yurimaguas (Provincia de Condorcanqui-Amazonas) y parte de la Provincia de Jaén. Es la zona de misión más extensa que tiene la Compañía de Jesús en el Perú y que desde entonces también trabaja cercanamente a las poblaciones originarias locales, awajún-wampis. En la foto un antiguo misionero jesuita y pobladores awajún, en los años 1940.