Una de las tareas inmediatas luego de la instalación del Moodle es la configuración o personalización del espacio virtual. Una parte de la configuración se lleva a cabo durante la instalación, ya sea definiendo algunos valores solicitados o dejando los valores iniciales por defecto. Sin embargo siempre hay oportunidad de configurar el entorno del espacio virtual luego de finalizar la instalación o en cualquier momento que se requiera.

La configuración del espacio virtual se refiere a la personalización y adaptación del entorno, ya sea de manera funcional o visual, por ejemplo, asignar ciertos permisos a los usuarios, cambiar el diseño gráfico del sitio, modificar el orden de los elementos presentados, etc.